Gidroekologiya kursi oqar suvlar (daryo, soylar, kanallar, dollektorlat va b.) va suv havzalari (ko'llar, suv omborlari, hovuzlar, vetlandlar) ekosistemalarida bolayotgan o’zgarishlarni va jarayonlarni juda fanlararo ekologik zamonaviy tadqiqot yondashuvlarini qollagan holda o’rganishga bag’ishlangan. Oqar (lotik) va oqmas (lentik) suv ekosistemalarini ekologik holatini ifodalovchi fizik, kimyoviy va biologik jarayonlarning asosiy tushunchalariga e'tibor qaratadi. Talabalar gidroekologiya sohasida o'rganish tamoyillari, tushunchalari va usullarini o'rganadilar va suv ekotizimlarini tadqiq etish va tavsiflashda tajribaga ega bo'ladilar. Professor-oqituvchi tomonidan shakllantirilgan mustaqil yoki guruhli tadqiqotlarning kundalik ishtiroki, va yozma va og'zaki hisobotlari, imtihonlari talab qilinadi.